Eksempler på sykdommer som faller inn under barnekirurgi er
- Misdannelser i skjelettsystemet (f.eks. overtallige fingre eller tær, klumpfot, traktbryst) og i hodeområdet (f.eks. leppe- og ganespalte);
- Benbrudd og dislokasjoner (f.eks. av kneskålen);
- Brannskader og kjemiske brannskader;
- Hode- og ryggskader;
- Lidelser og misdannelser i sentralnervesystemet (f.eks. hydrocephalus, spina bifida = "åpen rygg");
- Kontusioner og rifter i området av de indre organene (f.eks. milt, lever, mage, lunger);
- godartede og ondartede svulster (f.eks. blodsvamper, Ewings sarkom, Wilms svulst);
- Sykdommer i skjoldbruskkjertelen og binyrene;
- Sykdommer, forstyrrelser og misdannelser i fordøyelseskanalen (f.eks. gulsott, tarmpolypper, svelget fremmedlegemer);
- Sykdommer, skader og misdannelser i urinveiene og kjønnsorganene (f.eks. blæreskade, phimosis, testikkelvridning, misdannelser i livmoren);
- Funksjonelle forstyrrelser i urinveiene (f.eks. sengevæting);
- Brokk (f.eks. lyskebrokk), navlemisdannelser, bukveggdefekter, diafragmatiske lidelser;