Følgende symptomer og klager kan indikere japansk encefalitt:
- Mild influensa-liknende sykdom - i de fleste tilfeller.
Meningoencefalitt* (forekomst: 1 av 250 infeksjoner).
- Omtrent hvert 250. tilfelle av infeksjon.
- Høy feber, vanligvis 10 dager.
- Generell sykdomsfølelse
- Cephalgia (hodepine)
- Kvalme / oppkast
- Forstyrrelse av bevissthet
- Beslag
- Refleksforstyrrelser
- Forvirring
- Behaviorale endringer
- Skjelving (skjelver)
- Parese (motorisk lammelse)
- Gangforstyrrelser
- Coma
* Kombinert betennelse i hjernen (encefalitt) Og hjernehinnene (hjernehinnebetennelse) Dødeligheten (dødeligheten i forhold til det totale antallet mennesker som lider av sykdommen) i CNS-involvering er 30-35%. Barn og eldre er mer sannsynlig å få sykdommen alvorligere.