Medikament terapi brukes vanligvis til alveolar echinokokkose, da det vanligvis er for sent for radikal kirurgi ved diagnose.
Terapi for cystisk echinokokkose skal alltid utføres i angitte sentre. Generelt finnes det flere terapeutiske alternativer:
Se og vent - vent på inaktive, asymptomatiske cyster.
Medikamentell terapi
Operativ terapi
Punktering-Aspiration-Injection-Reaspiration (PAIR) - innsetting av steriliserende oppløsning i cysten; samtidig medikament terapi med albendazole administreres.